1、從生長環境來區別：黃苦蕎一般生長于海拔1500米以上的高寒山區，黑苦蕎則是生長于海拔2500米以上的高寒山區。

2、從外觀上來區別：黃苦蕎的外殼為黃灰色，黑苦蕎的外殼為黑色。脫殼之后差別會變小，黑苦蕎僅比黃苦蕎稍黑。

3、從產量上來區別：黃苦蕎的產量較高，一般畝產在500斤左右，黑苦蕎產量則較低，一般畝產在200斤左右。

4、從營養價值上來區別：黑苦蕎有“黑珍珠”之稱，其生物類黃酮蘆丁含量是黃苦蕎的3~5倍，其他所含有的營養價值都比黃苦蕎高。

5、從價格上來區別：黑苦蕎由于其產量少，營養價值高，所以價格也比黃苦蕎高。

綜合起來，黑苦蕎制成的苦蕎茶功效自然比黃苦蕎茶的功效要更好，也正是由于營養價值和成本等方面的原因，黑苦蕎茶的價格比黃苦蕎茶的價格要高。